############################################################################## TOPCONS2 result file Generated from http://commonbackend.computenode.pcons3.se at 2018-10-26 16:40:21 Total request time: 7.4 seconds. ############################################################################## Sequence number: 1 Sequence name: sp|Q12907|LMAN2_HUMAN Vesicular integral-membrane protein VIP36 OS=Homo sapiens GN=LMAN2 PE=1 SV=1 Sequence length: 356 aa. Sequence: MAAEGWIWRWGWGRRCLGRPGLLGPGPGPTTPLFLLLLLGSVTADITDGNSEHLKREHSLIKPYQGVGSSSMPLWDFQGSTMLTSQYVRLTPDERSKEGSIWNHQPCFLKDWEMHVHFKVHGTGKKNLHGDGIALWYTRDRLVPGPVFGSKDNFHGLAIFLDTYPNDETTERVFPYISVMVNNGSLSYDHSKDGRWTELAGCTADFRNRDHDTFLAVRYSRGRLTVMTDLEDKNEWKNCIDITGVRLPTGYYFGASAGTGDLSDNHDIISMKLFQLMVEHTPDEESIDWTKIEPSVNFLKSPKDNVDDPTGNFRSGPLTGWRVFLLLLCALLGIVVCAVVGAVVFQKRQERNKRFY TOPCONS predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiii OCTOPUS predicted topology: ooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMoooooooooooooo Philius predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiii PolyPhobius predicted topology: ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiii SCAMPI predicted topology: iiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiii SPOCTOPUS predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiii Homology: No homologous hits found Predicted Delta-G-values (kcal/mol) (left column=sequence position; right column=Delta-G) 10 5.753 11 6.277 12 6.653 13 6.319 14 5.291 15 5.292 16 5.848 17 6.068 18 6.320 19 6.286 20 6.770 21 6.271 22 6.345 23 6.522 24 6.293 25 6.196 26 5.891 27 5.974 28 5.361 29 4.887 30 3.829 31 3.485 32 3.777 33 3.618 34 2.919 35 2.008 36 1.674 37 1.112 38 0.851 39 1.062 40 1.743 41 2.662 42 3.385 43 5.298 44 6.862 45 7.560 46 8.686 47 9.552 48 10.723 49 11.792 50 12.197 51 11.707 52 11.888 53 12.381 54 13.121 55 12.741 56 13.167 57 13.300 58 12.511 59 12.109 60 11.716 61 11.356 62 10.615 63 9.902 64 10.486 65 9.541 66 8.931 67 8.407 68 7.097 69 6.909 70 7.472 71 8.104 72 8.048 73 8.000 74 7.804 75 7.297 76 7.222 77 7.681 78 7.030 79 6.243 80 5.679 81 4.792 82 4.825 83 5.166 84 6.426 85 7.627 86 7.834 87 9.020 88 9.311 89 10.060 90 10.628 91 11.403 92 11.500 93 11.621 94 12.092 95 12.255 96 12.015 97 12.334 98 12.076 99 11.400 100 10.984 101 10.710 102 10.331 103 9.584 104 9.742 105 9.775 106 9.951 107 9.938 108 10.442 109 10.087 110 10.107 111 10.249 112 10.983 113 10.266 114 9.372 115 9.001 116 8.565 117 8.666 118 9.352 119 9.404 120 10.280 121 10.726 122 11.724 123 11.905 124 11.974 125 11.235 126 10.758 127 9.654 128 9.103 129 8.035 130 7.526 131 7.093 132 6.752 133 6.455 134 6.360 135 7.012 136 7.540 137 7.995 138 8.829 139 8.121 140 7.910 141 7.465 142 6.867 143 6.779 144 6.808 145 6.755 146 7.752 147 8.389 148 8.385 149 8.690 150 8.465 151 8.315 152 8.257 153 8.382 154 7.590 155 6.740 156 6.393 157 6.883 158 7.527 159 7.883 160 7.961 161 8.098 162 8.646 163 8.723 164 9.362 165 8.696 166 9.049 167 9.673 168 9.615 169 9.993 170 10.139 171 10.345 172 9.727 173 10.018 174 10.160 175 9.233 176 8.529 177 7.160 178 6.268 179 5.868 180 6.063 181 6.064 182 6.661 183 7.423 184 8.872 185 9.463 186 10.309 187 10.693 188 10.673 189 11.518 190 11.560 191 11.841 192 11.717 193 11.137 194 10.718 195 10.177 196 10.577 197 9.420 198 8.825 199 8.587 200 7.449 201 7.148 202 7.714 203 8.392 204 8.955 205 9.760 206 10.349 207 10.923 208 10.505 209 10.772 210 10.236 211 9.505 212 8.756 213 8.406 214 7.980 215 7.133 216 7.376 217 7.437 218 6.871 219 6.993 220 7.198 221 6.148 222 6.264 223 6.550 224 6.912 225 7.548 226 8.354 227 8.410 228 8.972 229 10.038 230 10.298 231 10.720 232 11.103 233 11.341 234 11.972 235 12.291 236 12.069 237 11.635 238 10.698 239 10.250 240 10.022 241 8.896 242 8.003 243 7.207 244 5.925 245 5.496 246 5.773 247 6.101 248 5.573 249 5.914 250 5.917 251 5.572 252 5.854 253 5.319 254 5.286 255 5.630 256 6.256 257 7.316 258 7.794 259 8.253 260 8.417 261 9.306 262 9.697 263 10.427 264 9.908 265 9.501 266 9.548 267 9.028 268 8.456 269 8.034 270 7.993 271 7.763 272 7.902 273 7.986 274 7.951 275 7.883 276 8.226 277 8.679 278 9.069 279 9.759 280 9.561 281 9.710 282 9.758 283 10.231 284 11.268 285 11.559 286 12.606 287 12.708 288 13.253 289 12.169 290 10.911 291 10.796 292 10.453 293 10.052 294 9.355 295 9.247 296 9.737 297 10.262 298 10.967 299 12.349 300 13.352 301 13.775 302 14.668 303 14.773 304 14.285 305 14.019 306 14.269 307 13.573 308 13.839 309 13.300 310 12.599 311 11.968 312 10.897 313 10.097 314 9.085 315 7.706 316 6.965 317 5.878 318 4.799 319 3.963 320 3.789 321 3.194 322 1.892 323 1.268 324 1.026 325 -0.155 326 -1.115 327 -1.914 328 -1.882 329 -2.053 330 -2.345 331 -2.207 332 -1.910 333 -1.933 334 -1.795 335 -1.521 336 -1.345 337 -0.601 338 0.137 339 0.475 340 1.287 341 3.129 342 4.366 343 5.478 344 6.935 345 8.123 346 9.111 347 10.073 Predicted TOPCONS reliability (left column=sequence position; 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