############################################################################## TOPCONS2 result file Generated from http://commonbackend.computenode.pcons3.se at 2018-10-26 16:40:37 Total request time: 10.4 seconds. ############################################################################## Sequence number: 1 Sequence name: sp|Q13445|TMED1_HUMAN Transmembrane emp24 domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens GN=TMED1 PE=1 SV=1 Sequence length: 227 aa. Sequence: MMAAGAALALALWLLMPPVEVGGAGPPPIQDGEFTFLLPAGRKQCFYQSAPANASLETEYQVIGGAGLDVDFTLESPQGVLLVSESRKADGVHTVEPTEAGDYKLCFDNSFSTISEKLVFFELIFDSLQDDEEVEGWAEAVEPEEMLDVKMEDIKESIETMRTRLERSIQMLTLLRAFEARDRNLQEGNLERVNFWSAVNVAVLLLVAVLQVCTLKRFFQDKRPVPT TOPCONS predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiii OCTOPUS predicted topology: iMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiii Philius predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiii PolyPhobius predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiii SCAMPI predicted topology: iiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiii SPOCTOPUS predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiii Homology: No homologous hits found Predicted Delta-G-values (kcal/mol) (left column=sequence position; right column=Delta-G) 10 0.446 11 1.512 12 1.813 13 2.270 14 2.754 15 2.605 16 2.948 17 3.233 18 3.958 19 4.556 20 5.123 21 5.933 22 7.324 23 8.343 24 9.575 25 9.916 26 10.203 27 9.771 28 9.214 29 8.800 30 8.355 31 8.308 32 8.253 33 7.669 34 7.624 35 7.479 36 7.111 37 6.550 38 6.168 39 6.901 40 7.197 41 7.341 42 7.872 43 7.509 44 8.399 45 8.339 46 8.856 47 8.744 48 9.292 49 8.659 50 9.082 51 8.393 52 8.543 53 8.115 54 7.455 55 7.961 56 8.911 57 9.110 58 8.941 59 7.967 60 8.033 61 7.301 62 7.469 63 6.402 64 6.320 65 5.653 66 6.637 67 6.433 68 7.014 69 7.334 70 8.162 71 7.852 72 7.796 73 7.471 74 6.934 75 6.598 76 7.080 77 6.822 78 6.936 79 6.666 80 6.585 81 6.536 82 7.319 83 7.729 84 9.225 85 9.417 86 9.632 87 10.085 88 10.524 89 10.241 90 10.589 91 10.666 92 11.133 93 11.111 94 10.496 95 10.014 96 9.248 97 9.365 98 9.070 99 9.736 100 10.055 101 10.476 102 10.278 103 10.046 104 10.013 105 9.755 106 9.359 107 9.347 108 9.254 109 8.193 110 7.978 111 7.164 112 6.473 113 7.053 114 6.316 115 6.464 116 5.920 117 6.075 118 5.784 119 4.609 120 4.807 121 5.726 122 5.965 123 6.943 124 8.363 125 8.509 126 8.941 127 9.731 128 10.308 129 10.435 130 11.174 131 11.365 132 10.497 133 11.307 134 11.853 135 12.562 136 12.615 137 12.166 138 11.940 139 11.395 140 10.810 141 10.492 142 9.657 143 9.881 144 10.623 145 10.159 146 10.593 147 11.970 148 12.582 149 12.194 150 13.159 151 13.334 152 12.639 153 12.237 154 11.479 155 10.476 156 9.980 157 10.751 158 10.286 159 10.652 160 10.544 161 11.375 162 10.815 163 10.343 164 10.401 165 9.421 166 7.835 167 6.909 168 6.239 169 4.441 170 4.318 171 4.010 172 3.920 173 4.333 174 4.695 175 6.218 176 5.721 177 6.716 178 7.724 179 8.718 180 9.396 181 9.531 182 10.995 183 11.082 184 11.127 185 11.791 186 11.054 187 10.339 188 10.410 189 9.394 190 9.202 191 9.501 192 9.073 193 8.806 194 7.802 195 7.219 196 5.719 197 4.349 198 3.535 199 2.371 200 2.269 201 0.960 202 1.246 203 1.139 204 0.559 205 0.895 206 0.692 207 0.493 208 0.631 209 0.520 210 -0.142 211 0.772 212 2.021 213 3.249 214 4.646 215 6.625 216 8.035 217 9.091 218 9.595 Predicted TOPCONS reliability (left column=sequence position; right column=reliability) 11 60.00 12 60.00 13 60.00 14 60.00 15 61.90 16 63.81 17 65.71 18 67.62 19 69.52 20 71.43 21 73.33 22 75.24 23 77.14 24 79.05 25 80.95 26 82.86 27 84.76 28 86.67 29 88.57 30 90.48 31 92.38 32 94.29 33 96.19 34 98.10 35 100.00 36 100.00 37 100.00 38 100.00 39 100.00 40 100.00 41 100.00 42 100.00 43 100.00 44 100.00 45 100.00 46 100.00 47 100.00 48 100.00 49 100.00 50 100.00 51 100.00 52 100.00 53 100.00 54 100.00 55 100.00 56 100.00 57 100.00 58 100.00 59 100.00 60 100.00 61 100.00 62 100.00 63 100.00 64 100.00 65 100.00 66 100.00 67 100.00 68 100.00 69 100.00 70 100.00 71 100.00 72 100.00 73 100.00 74 100.00 75 100.00 76 100.00 77 100.00 78 100.00 79 100.00 80 100.00 81 100.00 82 100.00 83 100.00 84 100.00 85 100.00 86 100.00 87 100.00 88 100.00 89 100.00 90 100.00 91 100.00 92 100.00 93 100.00 94 100.00 95 100.00 96 100.00 97 100.00 98 100.00 99 100.00 100 100.00 101 100.00 102 100.00 103 100.00 104 100.00 105 100.00 106 100.00 107 100.00 108 100.00 109 100.00 110 100.00 111 100.00 112 100.00 113 100.00 114 100.00 115 100.00 116 100.00 117 100.00 118 100.00 119 100.00 120 100.00 121 100.00 122 100.00 123 100.00 124 100.00 125 100.00 126 100.00 127 100.00 128 100.00 129 100.00 130 100.00 131 100.00 132 100.00 133 100.00 134 100.00 135 100.00 136 100.00 137 100.00 138 100.00 139 100.00 140 100.00 141 100.00 142 100.00 143 100.00 144 100.00 145 100.00 146 100.00 147 100.00 148 100.00 149 100.00 150 100.00 151 100.00 152 100.00 153 100.00 154 100.00 155 100.00 156 100.00 157 100.00 158 100.00 159 100.00 160 100.00 161 100.00 162 100.00 163 100.00 164 100.00 165 100.00 166 100.00 167 100.00 168 100.00 169 100.00 170 100.00 171 100.00 172 100.00 173 100.00 174 100.00 175 100.00 176 100.00 177 100.00 178 100.00 179 100.00 180 100.00 181 100.00 182 100.00 183 99.05 184 98.10 185 96.19 186 96.19 187 96.19 188 96.19 189 96.19 190 96.19 191 96.19 192 96.19 193 96.19 194 96.19 195 96.19 196 96.19 197 96.19 198 96.19 199 96.19 200 96.19 201 96.19 202 96.19 203 96.19 204 97.14 205 98.10 206 98.10 207 98.10 208 98.10 209 98.10 210 98.10 211 98.10 212 98.10 213 98.10 214 98.10 215 98.10 216 98.10 ##############################################################################