############################################################################## TOPCONS2 result file Generated from http://commonbackend.computenode.pcons3.se at 2018-10-26 16:43:16 Total request time: 9.5 seconds. ############################################################################## Sequence number: 1 Sequence name: sp|Q9BVK6|TMED9_HUMAN Transmembrane emp24 domain-containing protein 9 OS=Homo sapiens GN=TMED9 PE=1 SV=2 Sequence length: 235 aa. Sequence: MAVELGVLLVRPRPGTGLGRVMRTLLLVLWLATRGSALYFHIGETEKKCFIEEIPDETMVIGNYRTQLYDKQREEYQPATPGLGMFVEVKDPEDKVILARQYGSEGRFTFTSHTPGEHQICLHSNSTKFSLFAGGMLRVHLDIQVGEHANDYAEIAAKDKLSELQLRVRQLVEQVEQIQKEQNYQRWREERFRQTSESTNQRVLWWSILQTLILVAIGVWQMRHLKSFFEAKKLV TOPCONS predicted topology: iiiiiiiiiiiiiiiiiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiii OCTOPUS predicted topology: iiiiiiiiiiiiiiiiiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiii Philius predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiii PolyPhobius predicted topology: ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiii SCAMPI predicted topology: iiiiiiiiiiiiiiiiiiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiii SPOCTOPUS predicted topology: iiiiiiiiiiiiiiiiiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiii Homology: No homologous hits found Predicted Delta-G-values (kcal/mol) (left column=sequence position; right column=Delta-G) 10 5.841 11 6.352 12 6.570 13 6.517 14 5.868 15 6.087 16 5.262 17 4.857 18 4.722 19 5.184 20 4.908 21 4.492 22 3.176 23 2.655 24 1.768 25 0.966 26 0.791 27 0.421 28 0.614 29 -0.004 30 0.242 31 0.341 32 1.517 33 1.803 34 2.195 35 3.276 36 3.678 37 4.417 38 4.850 39 5.859 40 6.437 41 6.838 42 7.115 43 8.136 44 9.031 45 9.072 46 9.588 47 10.224 48 11.282 49 11.420 50 11.539 51 10.663 52 10.497 53 10.257 54 10.166 55 9.799 56 8.838 57 8.398 58 8.589 59 8.315 60 8.457 61 9.031 62 8.831 63 9.065 64 9.798 65 10.808 66 11.620 67 11.536 68 12.497 69 13.408 70 13.802 71 14.200 72 14.657 73 14.283 74 13.785 75 13.460 76 12.640 77 11.046 78 10.598 79 10.660 80 9.490 81 8.800 82 8.392 83 8.670 84 8.397 85 8.394 86 9.161 87 9.092 88 9.308 89 9.590 90 10.171 91 10.151 92 10.705 93 10.978 94 10.539 95 10.442 96 11.152 97 11.265 98 10.504 99 9.988 100 9.418 101 8.581 102 7.956 103 7.446 104 7.463 105 7.340 106 7.979 107 8.434 108 9.192 109 9.619 110 10.147 111 9.476 112 9.495 113 8.744 114 9.000 115 8.503 116 8.612 117 9.045 118 9.367 119 9.474 120 9.345 121 9.717 122 8.936 123 8.239 124 8.203 125 8.164 126 8.177 127 7.354 128 6.442 129 5.805 130 5.564 131 5.573 132 5.084 133 4.780 134 4.209 135 4.352 136 4.408 137 5.048 138 5.569 139 6.681 140 6.414 141 7.299 142 8.106 143 8.261 144 8.205 145 9.021 146 9.337 147 10.095 148 10.385 149 10.894 150 10.692 151 11.406 152 10.897 153 11.531 154 11.576 155 11.386 156 11.706 157 10.492 158 9.725 159 9.548 160 8.910 161 9.052 162 8.862 163 8.762 164 9.048 165 9.865 166 9.985 167 10.648 168 11.025 169 10.396 170 10.345 171 10.634 172 10.634 173 10.225 174 11.214 175 10.888 176 12.061 177 12.443 178 12.550 179 12.747 180 12.892 181 14.083 182 14.439 183 14.037 184 14.130 185 15.038 186 14.557 187 14.605 188 15.341 189 14.776 190 14.244 191 14.091 192 13.825 193 12.930 194 12.655 195 11.388 196 10.723 197 10.161 198 9.902 199 8.772 200 7.492 201 7.795 202 7.887 203 7.134 204 6.311 205 5.382 206 4.428 207 3.367 208 2.503 209 2.322 210 1.110 211 0.097 212 0.342 213 0.222 214 0.677 215 1.609 216 1.645 217 1.783 218 2.684 219 3.359 220 3.442 221 5.080 222 6.355 223 7.190 224 8.002 225 7.669 226 7.616 Predicted TOPCONS reliability (left column=sequence position; right column=reliability) 11 59.05 12 59.05 13 59.05 14 59.05 15 59.05 16 59.05 17 59.05 18 59.05 19 59.05 20 59.05 21 59.05 22 59.05 23 59.05 24 59.05 25 59.05 26 59.05 27 59.05 28 59.05 29 59.05 30 60.95 31 62.86 32 64.76 33 66.67 34 68.57 35 70.48 36 72.38 37 74.29 38 76.19 39 78.10 40 80.00 41 81.90 42 83.81 43 85.71 44 87.62 45 89.52 46 91.43 47 93.33 48 95.24 49 97.14 50 99.05 51 100.00 52 100.00 53 100.00 54 100.00 55 100.00 56 100.00 57 100.00 58 100.00 59 100.00 60 100.00 61 100.00 62 100.00 63 100.00 64 100.00 65 100.00 66 100.00 67 100.00 68 100.00 69 100.00 70 100.00 71 100.00 72 100.00 73 100.00 74 100.00 75 100.00 76 100.00 77 100.00 78 100.00 79 100.00 80 100.00 81 100.00 82 100.00 83 100.00 84 100.00 85 100.00 86 100.00 87 100.00 88 100.00 89 100.00 90 100.00 91 100.00 92 100.00 93 100.00 94 100.00 95 100.00 96 100.00 97 100.00 98 100.00 99 100.00 100 100.00 101 100.00 102 100.00 103 100.00 104 100.00 105 100.00 106 100.00 107 100.00 108 100.00 109 100.00 110 100.00 111 100.00 112 100.00 113 100.00 114 100.00 115 100.00 116 100.00 117 100.00 118 100.00 119 100.00 120 100.00 121 100.00 122 100.00 123 100.00 124 100.00 125 100.00 126 100.00 127 100.00 128 100.00 129 100.00 130 100.00 131 100.00 132 100.00 133 100.00 134 100.00 135 100.00 136 100.00 137 100.00 138 100.00 139 100.00 140 100.00 141 100.00 142 100.00 143 100.00 144 100.00 145 100.00 146 100.00 147 100.00 148 100.00 149 100.00 150 100.00 151 100.00 152 100.00 153 100.00 154 100.00 155 100.00 156 100.00 157 100.00 158 100.00 159 100.00 160 100.00 161 100.00 162 100.00 163 100.00 164 100.00 165 100.00 166 100.00 167 100.00 168 100.00 169 100.00 170 100.00 171 100.00 172 100.00 173 100.00 174 100.00 175 100.00 176 100.00 177 100.00 178 100.00 179 100.00 180 100.00 181 100.00 182 100.00 183 100.00 184 100.00 185 100.00 186 100.00 187 100.00 188 100.00 189 100.00 190 100.00 191 100.00 192 99.05 193 97.14 194 97.14 195 97.14 196 97.14 197 97.14 198 97.14 199 97.14 200 97.14 201 97.14 202 97.14 203 97.14 204 97.14 205 97.14 206 97.14 207 97.14 208 97.14 209 97.14 210 97.14 211 97.14 212 97.14 213 95.24 214 95.24 215 95.24 216 95.24 217 95.24 218 95.24 219 95.24 220 95.24 221 95.24 222 95.24 223 95.24 224 95.24 ##############################################################################