############################################################################## TOPCONS2 result file Generated from http://commonbackend.computenode.pcons3.se at 2018-10-26 16:43:37 Total request time: 8.4 seconds. ############################################################################## Sequence number: 1 Sequence name: sp|Q9Y3B3|TMED7_HUMAN Transmembrane emp24 domain-containing protein 7 OS=Homo sapiens GN=TMED7 PE=1 SV=2 Sequence length: 224 aa. Sequence: MPRPGSAQRWAAVAGRWGCRLLALLLLVPGPGGASEITFELPDNAKQCFYEDIAQGTKCTLEFQVITGGHYDVDCRLEDPDGKVLYKEMKKQYDSFTFTASKNGTYKFCFSNEFSTFTHKTVYFDFQVGEDPPLFPSENRVSALTQMESACVSIHEALKSVIDYQTHFRLREAQGRSRAEDLNTRVAYWSVGEALILLVVSIGQVFLLKSFFSDKRTTTTRVGS TOPCONS predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiii OCTOPUS predicted topology: iiiiiiiiiiiiiiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiii Philius predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiii PolyPhobius predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiii SCAMPI predicted topology: iiiiiiiiiiiiiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiii SPOCTOPUS predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiii Homology: No homologous hits found Predicted Delta-G-values (kcal/mol) (left column=sequence position; right column=Delta-G) 10 7.177 11 6.802 12 5.799 13 5.220 14 4.731 15 4.039 16 3.485 17 3.066 18 2.051 19 1.856 20 1.954 21 1.754 22 1.648 23 1.421 24 1.516 25 1.082 26 1.402 27 2.512 28 2.294 29 2.632 30 2.658 31 4.154 32 4.609 33 5.251 34 6.363 35 7.705 36 8.402 37 9.277 38 10.281 39 10.219 40 10.208 41 10.093 42 10.662 43 10.894 44 11.087 45 10.977 46 10.815 47 11.180 48 11.026 49 11.354 50 10.352 51 10.551 52 9.675 53 9.979 54 8.945 55 9.201 56 8.888 57 8.091 58 7.931 59 8.140 60 8.182 61 7.480 62 6.611 63 6.663 64 6.313 65 6.062 66 6.085 67 6.496 68 6.453 69 7.661 70 8.484 71 9.684 72 10.049 73 11.225 74 11.435 75 11.945 76 11.975 77 11.810 78 11.503 79 11.484 80 10.978 81 11.389 82 11.357 83 11.997 84 11.901 85 12.620 86 13.273 87 13.737 88 13.488 89 12.848 90 12.202 91 11.574 92 11.288 93 10.842 94 10.925 95 11.080 96 10.675 97 9.722 98 8.692 99 8.156 100 7.873 101 7.432 102 7.405 103 8.171 104 8.776 105 8.150 106 8.650 107 8.467 108 8.074 109 7.716 110 8.043 111 7.581 112 7.292 113 6.956 114 6.713 115 6.638 116 7.214 117 7.017 118 8.227 119 8.478 120 8.990 121 9.404 122 9.082 123 8.766 124 9.503 125 8.735 126 8.418 127 8.855 128 9.078 129 8.822 130 9.334 131 9.543 132 9.717 133 10.191 134 10.452 135 9.691 136 9.883 137 10.123 138 10.163 139 10.216 140 9.928 141 9.381 142 8.580 143 7.992 144 8.521 145 8.439 146 8.211 147 8.443 148 7.488 149 6.507 150 6.681 151 7.087 152 6.748 153 6.806 154 7.829 155 7.984 156 8.140 157 8.477 158 8.834 159 8.662 160 9.019 161 8.790 162 8.855 163 8.953 164 9.031 165 9.138 166 8.879 167 9.142 168 9.926 169 9.799 170 9.397 171 9.886 172 10.233 173 9.708 174 10.634 175 10.361 176 10.617 177 10.275 178 10.465 179 10.106 180 9.892 181 9.680 182 8.857 183 9.085 184 9.013 185 8.746 186 7.992 187 6.906 188 5.895 189 4.815 190 3.688 191 2.802 192 3.099 193 1.897 194 1.753 195 2.088 196 2.014 197 1.836 198 1.518 199 1.221 200 0.985 201 1.450 202 1.075 203 0.309 204 0.914 205 2.225 206 3.119 207 4.013 208 4.976 209 5.571 210 6.128 211 6.433 212 7.079 213 7.214 214 7.680 215 8.546 Predicted TOPCONS reliability (left column=sequence position; right column=reliability) 11 60.00 12 60.00 13 60.00 14 60.00 15 60.00 16 60.00 17 60.00 18 60.00 19 60.00 20 60.00 21 57.14 22 54.29 23 51.43 24 48.57 25 48.57 26 49.52 27 51.43 28 53.33 29 55.24 30 57.14 31 59.05 32 60.95 33 62.86 34 64.76 35 66.67 36 68.57 37 70.48 38 72.38 39 74.29 40 76.19 41 78.10 42 82.86 43 87.62 44 92.38 45 97.14 46 99.05 47 100.00 48 100.00 49 100.00 50 100.00 51 100.00 52 100.00 53 100.00 54 100.00 55 100.00 56 100.00 57 100.00 58 100.00 59 100.00 60 100.00 61 100.00 62 100.00 63 100.00 64 100.00 65 100.00 66 100.00 67 100.00 68 100.00 69 100.00 70 100.00 71 100.00 72 100.00 73 100.00 74 100.00 75 100.00 76 100.00 77 100.00 78 100.00 79 100.00 80 100.00 81 100.00 82 100.00 83 100.00 84 100.00 85 100.00 86 100.00 87 100.00 88 100.00 89 100.00 90 100.00 91 100.00 92 100.00 93 100.00 94 100.00 95 100.00 96 100.00 97 100.00 98 100.00 99 100.00 100 100.00 101 100.00 102 100.00 103 100.00 104 100.00 105 100.00 106 100.00 107 100.00 108 100.00 109 100.00 110 100.00 111 100.00 112 100.00 113 100.00 114 100.00 115 100.00 116 100.00 117 100.00 118 100.00 119 100.00 120 100.00 121 100.00 122 100.00 123 100.00 124 100.00 125 100.00 126 100.00 127 100.00 128 100.00 129 100.00 130 100.00 131 100.00 132 100.00 133 100.00 134 100.00 135 100.00 136 100.00 137 100.00 138 100.00 139 100.00 140 100.00 141 100.00 142 100.00 143 100.00 144 100.00 145 100.00 146 100.00 147 100.00 148 100.00 149 100.00 150 100.00 151 100.00 152 100.00 153 100.00 154 100.00 155 100.00 156 100.00 157 100.00 158 100.00 159 100.00 160 100.00 161 100.00 162 100.00 163 100.00 164 100.00 165 100.00 166 100.00 167 100.00 168 100.00 169 100.00 170 100.00 171 100.00 172 100.00 173 100.00 174 100.00 175 100.00 176 98.10 177 96.19 178 96.19 179 96.19 180 96.19 181 96.19 182 96.19 183 96.19 184 96.19 185 96.19 186 96.19 187 96.19 188 96.19 189 96.19 190 96.19 191 96.19 192 96.19 193 96.19 194 96.19 195 96.19 196 96.19 197 98.10 198 100.00 199 100.00 200 100.00 201 100.00 202 100.00 203 100.00 204 100.00 205 100.00 206 100.00 207 100.00 208 100.00 209 100.00 210 100.00 211 100.00 212 100.00 213 100.00 ##############################################################################