############################################################################## TOPCONS2 result file Generated from http://commonbackend.computenode.pcons3.se at 2018-10-26 02:39:38 Total request time: 22.2 seconds. ############################################################################## Sequence number: 1 Sequence name: sp|Q9Y624|JAM1_HUMAN Junctional adhesion molecule A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=F11R PE=1 SV=1 Sequence length: 299 aa. Sequence: MGTKAQVERKLLCLFILAILLCSLALGSVTVHSSEPEVRIPENNPVKLSCAYSGFSSPRVEWKFDQGDTTRLVCYNNKITASYEDRVTFLPTGITFKSVTREDTGTYTCMVSEEGGNSYGEVKVKLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQDGSPPSEYTWFKDGIVMPTNPKSTRAFSNSSYVLNPTTGELVFDPLSASDTGEYSCEARNGYGTPMTSNAVRMEAVERNVGVIVAAVLVTLILLGILVFGIWFAYSRGHFDRTKKGTSSKKVIYSQPSARSEGEFKQTSSFLV TOPCONS predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii OCTOPUS predicted topology: iiiiiiiiiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii Philius predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii PolyPhobius predicted topology: ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii SCAMPI predicted topology: iiiiiiiiiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii SPOCTOPUS predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii 2m59A: ------------------------------ooooooooooooooooooooo--o--oooooooooooooooo--oooooooo--oooooooo-ooooooooooooooooooooo----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Predicted Delta-G-values (kcal/mol) (left column=sequence position; right column=Delta-G) 10 5.493 11 4.221 12 2.440 13 1.369 14 0.601 15 -0.604 16 -1.459 17 -2.224 18 -2.729 19 -2.374 20 -2.527 21 -2.012 22 -1.345 23 -0.610 24 0.487 25 1.484 26 2.518 27 3.781 28 4.701 29 5.249 30 5.942 31 6.594 32 7.296 33 8.187 34 9.795 35 10.782 36 11.988 37 12.181 38 12.418 39 12.419 40 12.779 41 12.581 42 11.506 43 10.681 44 10.305 45 9.727 46 8.736 47 8.404 48 8.797 49 9.077 50 8.939 51 8.284 52 8.150 53 7.140 54 6.904 55 6.320 56 6.984 57 7.528 58 8.787 59 9.590 60 10.297 61 10.817 62 11.179 63 10.589 64 10.175 65 10.289 66 9.643 67 9.633 68 9.392 69 9.607 70 9.589 71 8.936 72 8.849 73 8.577 74 8.367 75 8.318 76 8.244 77 8.058 78 8.054 79 8.362 80 8.274 81 8.115 82 8.952 83 9.091 84 9.400 85 9.245 86 8.495 87 7.079 88 6.509 89 6.473 90 6.051 91 5.750 92 5.285 93 6.060 94 5.736 95 5.758 96 6.611 97 7.172 98 7.598 99 8.248 100 8.987 101 8.708 102 8.697 103 8.618 104 9.072 105 9.255 106 9.425 107 9.197 108 9.229 109 9.252 110 8.830 111 8.828 112 8.677 113 8.350 114 8.890 115 9.046 116 9.757 117 9.963 118 10.056 119 10.116 120 9.703 121 9.427 122 9.302 123 8.770 124 8.009 125 7.724 126 7.813 127 7.047 128 6.700 129 7.482 130 7.173 131 7.048 132 7.769 133 8.308 134 8.591 135 8.510 136 8.614 137 8.788 138 8.856 139 8.738 140 8.342 141 7.566 142 6.640 143 6.209 144 6.009 145 6.259 146 7.279 147 7.964 148 7.877 149 8.364 150 8.250 151 8.205 152 8.379 153 8.989 154 9.941 155 10.297 156 10.150 157 9.673 158 9.433 159 9.847 160 10.404 161 11.234 162 11.319 163 11.437 164 11.020 165 10.649 166 10.175 167 10.327 168 10.073 169 9.475 170 9.050 171 8.224 172 7.606 173 7.183 174 7.151 175 7.970 176 9.359 177 10.438 178 10.990 179 10.917 180 10.581 181 10.210 182 10.412 183 10.506 184 9.522 185 9.046 186 8.514 187 8.415 188 7.831 189 7.619 190 7.311 191 7.664 192 7.954 193 7.637 194 7.601 195 6.853 196 6.784 197 7.070 198 7.321 199 7.677 200 8.577 201 8.103 202 8.046 203 8.107 204 8.939 205 8.899 206 8.512 207 9.656 208 10.147 209 10.341 210 10.218 211 9.803 212 10.706 213 10.450 214 10.466 215 10.308 216 10.154 217 9.963 218 9.493 219 8.673 220 8.592 221 8.635 222 8.458 223 7.508 224 7.921 225 7.999 226 8.476 227 8.435 228 8.908 229 8.620 230 8.280 231 7.892 232 7.920 233 7.774 234 7.153 235 5.841 236 5.163 237 4.434 238 3.393 239 2.625 240 0.981 241 0.344 242 0.337 243 -0.515 244 -1.108 245 -1.726 246 -1.987 247 -1.895 248 -2.006 249 -2.190 250 -2.651 251 -2.855 252 -3.071 253 -2.702 254 -1.979 255 -1.265 256 0.041 257 0.953 258 2.055 259 3.019 260 4.066 261 4.823 262 6.131 263 7.668 264 8.454 265 9.773 266 10.443 267 11.330 268 12.140 269 12.635 270 12.574 271 12.298 272 11.928 273 11.962 274 11.511 275 11.157 276 11.201 277 10.537 278 10.612 279 10.997 280 10.713 281 11.024 282 10.333 283 10.496 284 11.037 285 10.899 286 11.138 287 11.540 288 11.350 289 11.127 290 10.935 Predicted TOPCONS reliability (left column=sequence position; right column=reliability) 11 40.00 12 40.00 13 40.00 14 40.00 15 40.00 16 40.00 17 40.00 18 40.00 19 40.00 20 40.00 21 39.05 22 40.95 23 42.86 24 45.71 25 48.57 26 51.43 27 54.29 28 57.14 29 60.00 30 62.86 31 65.71 32 68.57 33 71.43 34 74.29 35 77.14 36 80.00 37 82.86 38 85.71 39 88.57 40 91.43 41 94.29 42 98.10 43 99.05 44 100.00 45 100.00 46 100.00 47 100.00 48 100.00 49 100.00 50 100.00 51 100.00 52 100.00 53 100.00 54 100.00 55 100.00 56 100.00 57 100.00 58 100.00 59 100.00 60 100.00 61 100.00 62 100.00 63 100.00 64 100.00 65 100.00 66 100.00 67 100.00 68 100.00 69 100.00 70 100.00 71 100.00 72 100.00 73 100.00 74 100.00 75 100.00 76 100.00 77 100.00 78 100.00 79 100.00 80 100.00 81 100.00 82 100.00 83 100.00 84 100.00 85 100.00 86 100.00 87 100.00 88 100.00 89 100.00 90 100.00 91 100.00 92 100.00 93 100.00 94 100.00 95 100.00 96 100.00 97 100.00 98 100.00 99 100.00 100 100.00 101 100.00 102 100.00 103 100.00 104 100.00 105 100.00 106 100.00 107 100.00 108 100.00 109 100.00 110 100.00 111 100.00 112 100.00 113 100.00 114 100.00 115 100.00 116 100.00 117 100.00 118 100.00 119 100.00 120 100.00 121 100.00 122 100.00 123 100.00 124 100.00 125 100.00 126 100.00 127 100.00 128 100.00 129 100.00 130 100.00 131 100.00 132 100.00 133 100.00 134 100.00 135 100.00 136 100.00 137 100.00 138 100.00 139 100.00 140 100.00 141 100.00 142 100.00 143 100.00 144 100.00 145 100.00 146 100.00 147 100.00 148 100.00 149 100.00 150 100.00 151 100.00 152 100.00 153 100.00 154 100.00 155 100.00 156 100.00 157 100.00 158 100.00 159 100.00 160 100.00 161 100.00 162 100.00 163 100.00 164 100.00 165 100.00 166 100.00 167 100.00 168 100.00 169 100.00 170 100.00 171 100.00 172 100.00 173 100.00 174 100.00 175 100.00 176 100.00 177 100.00 178 100.00 179 100.00 180 100.00 181 100.00 182 100.00 183 100.00 184 100.00 185 100.00 186 100.00 187 100.00 188 100.00 189 100.00 190 100.00 191 100.00 192 100.00 193 100.00 194 100.00 195 100.00 196 100.00 197 100.00 198 100.00 199 100.00 200 100.00 201 100.00 202 100.00 203 100.00 204 100.00 205 100.00 206 100.00 207 100.00 208 100.00 209 100.00 210 100.00 211 100.00 212 100.00 213 100.00 214 100.00 215 100.00 216 100.00 217 100.00 218 100.00 219 100.00 220 100.00 221 100.00 222 100.00 223 100.00 224 100.00 225 100.00 226 100.00 227 98.10 228 97.14 229 96.19 230 95.24 231 95.24 232 95.24 233 95.24 234 95.24 235 95.24 236 95.24 237 95.24 238 95.24 239 95.24 240 95.24 241 95.24 242 95.24 243 95.24 244 95.24 245 95.24 246 95.24 247 95.24 248 94.29 249 92.38 250 90.48 251 89.52 252 89.52 253 89.52 254 89.52 255 89.52 256 89.52 257 89.52 258 89.52 259 89.52 260 89.52 261 89.52 262 89.52 263 89.52 264 89.52 265 89.52 266 89.52 267 89.52 268 89.52 269 92.38 270 95.24 271 98.10 272 100.00 273 100.00 274 100.00 275 100.00 276 100.00 277 100.00 278 100.00 279 100.00 280 100.00 281 100.00 282 100.00 283 100.00 284 100.00 285 100.00 286 100.00 287 100.00 288 100.00 ##############################################################################